COMPUTATIONAL SYSTEM BIOLOGY LABORATORY

We analyzed 7,315,181 Brazilian CVs and found 6,275 immunologists with PhD

Oficina da pós-graduação em Ciências da Saúde do Einstein

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Check the network of "fields of study"

If you have a great work in your hand, make sure to include some of these words in the title of your manuscript before submitting to Science or Nature.

RNA, the Epicenter of Genetic Information

Table with the number of research articles from PubMed that had authors from more than 1 country: click here Map below shows the countries whose scientists collaborated in at least 5,000 articles.

These are the Brazilian scientists who have published the highest number of articles related to COVID-19. Of the top 6 scientists, 5 were women! (We analyzed nearly 120,000 COVID-19 articles with more than 10,000 authors from Brazil) Check the table: link Reviews were excluded and there are authors with the same name

Research topics which are among the top 100 research priorities across countries.

Essas são as 25 instituições de pesquisas com mais indicações

Analyzing 30M scientific articles from the Biomedical literature

These images was conceived by Helder Nakaya and designed by Allan Rodrigo Nascimento de Carvalho. It depicts a robot thinking the same way as the Le Penseur (or The Thinker), a bronze sculpture by Auguste Rodin. The robot represents the artificial intelligence so common in our modern society.

Uma vaga de pós-doutorado em bioinformática / biologia de sistemas com foco em análise transcriptômica está disponível no Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias – CRID (http://crid.fmrp.usp.br), um Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPID) apoiado pela FAPESP com sede na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo. O candidato bem-sucedido se juntará ao Laboratório de Biologia de Sistemas Computacional (CSBL, https://www.csbiology.org). As atividades serão supervisionadas pelo Prof. Helder Nakaya. Responsabilidades O candidato trabalhará nas dependências do CRID, localizado na USP de Ribeirão Preto. Espera-se que o bolsista desempenhe papel de liderança na análise de dados, que inclui a integração de dados ômicos e o desenvolvimento de modelos preditivos e hipóteses testáveis. As responsabilidades específicas incluem: - Desenvolvimento de protocolos de análise para conjuntos de dados internos e públicos de expressões gênicas; - Desenvolvimento ou adaptação de ferramentas e scripts de software para atender às necessidades do projeto. Requisitos O candidato deverá ter experiência comprovada em pesquisa de bioinformática. A familiaridade com o trabalho em um ambiente Linux/Unix, além de fluência em linguagens de programação R ou Python, é necessária; Por favor, envie seu currículo com informações de contato, uma carta de motivação e pelo menos 2 cartas de recomendação ao Prof. Helder Nakaya, e-mail: hnakaya@usp.br. A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa. https://fapesp.br/oportunidades/crid_%E2%80%93_centro_de_pesquisa_em_doencas_inflamatorias/4611/

O Instituto Todos pela Saúde (ITpS) inicia o processo de pré-seleção para credenciamento de grupos de pesquisa que desenvolvam estudos de coortes, conforme orientações descritas a seguir. Os grupos pré-selecionados serão convocados para etapa subsequente de avaliação de propostas. Quando credenciados, os parceiros receberão recursos financeiros por um período de 2 anos, assumindo compromisso contratual para integração dos dados com o ITpS. 1 Objetivos do ITpS O ITpS tem o objetivo de obter informações de populações vacinadas e recuperadas de Covid-19, dentro de sua linha de ação “Estudos de coortes”. Objetivos específicos: i. Responder perguntas pré-estabelecidas nesta Chamada; ii. Potencializar estudos já existentes de grupos de pesquisa com recursos do ITpS, particularmente na área de sequenciamento genômico; iii. Compartilhar expertises e especialidades entre os parceiros do ITpS para auxiliar a execução dos projetos; iv. Compartilhar, organizar e análisar grandes volumes de dados de Saúde para orientar a tomada de decisões estratégicas em políticas públicas. 2 Condições para pré-candidatura Podem se apresentar para pré-seleção todos os grupos de pesquisa que já desenvolvam estudos relacionados aos objetivos pré-estabelecidos para Estudos de Coortes na seção 3. Eles deverão se comprometer a adequar seus escopos, a trabalhar em rede e a compartilhar informações e dados. Considera-se grupo candidato um conjunto de pesquisadores, de uma Instituição principal proponente, que operam cooperativamente em estudos de coortes. O grupo candidato deverá ser o gestor e responsável pelas ações necessárias para a realização dos estudos pactuados no ato do seu credenciamento, mesmo que parte das ações sejam desenvolvidas por parceiros colaboradores. Na condição de pré-candidato, o grupo deve: i. Demonstrar experiência no desenvolvimento de estudos de coortes de vacinados e/ou sobreviventes de Covid-19, por meio da apresentação de informações do estudo, tais como: objetivos; tamanho; características dos grupos de controle (se existentes); fonte de casos e cobertura geográfica; duração da coorte até o presente; frequência dos contatos; perguntas formuladas; testes e exames utilizados; resultados prévios (publicações ou preprints). ii. Possuir governança, autonomia decisória e de gestão local eficientes para desenvolver estudos referentes aos objetivos pré-estabelecidos e, para alocar pessoal e infraestrutura necessários. Isso implica na disponibilidade prévia de infraestrutura de pesquisa adequada e recursos humanos próprios; iii. Assumir compromisso com compartilhamento de dados na linha de ação desta chamada para que o ITpS possa elaborar macrorecomendações, em conjunto com demais parceiros e contribuir para melhorar políticas públicas, sem prejuízo de publicações de microdados do Parceiro. Não serão elegíveis os grupos que não apresentarem recursos humanos e infraestrutura próprios, suficientes e qualificados para desenvolver estudos de coortes. Também não serão elegíveis novas coortes ainda não iniciadas e que não tenham demonstrado resultados prévios ou que apresentem dados já publicados por outros grupos ou pelo governo. 3 Objetivos pré-estabelecidos para Estudos de Coortes Os candidatos deverão apresentar, na etapa de seleção subsequente, proposta completa incluindo um Plano de Ação com estratégias para adequar seus estudos atuais para adicionar respostas para os seguintes objetivos e perguntas de pesquisa: i. Objetivo 1 – Coortes de vacinados contra Covid-19: a. Qual o risco de infecção/doença/hospitalização/morte pós vacina, conforme: tipo de vacina; doses recebidas; espaçamento entre doses, tempo desde a imunização; região do país; sexo, idade, etnia, comorbidades? b. Qual a distribuição das variantes entre os infectados que foram vacinados? c. Tipos e frequência de efeitos colaterais pós vacina, conforme: tipo de vacina; doses recebidas; espaçamento entre doses, tempo desde a imunização; região do país; sexo, idade, etnia, comorbidades. ii. Objetivo 2 – Coortes de sobreviventes (não vacinados) da Covid-19: a. Qual o risco de infecção/doença/hospitalização/morte em indivíduos recuperados de Covid-19, conforme: tempo desde o primeiro episódio; gravidade dos sintomas; região do país; sexo, idade, etnia, comorbidades? b. Qual a distribuição das variantes entre os recuperados? c. Natureza, frequência, gravidade e duração de sintomas persistentes (Covid longa). 4 Itens financiáveis Os recursos financeiros aportados aos estudos de coortes pelo ITpS se destinarão exclusivamente ao custeio de despesas referentes aos seguintes itens de dispêndio: i. Bolsas; ii. Material de consumo/ insumos; iii. Viagens – Diárias, passagens e despesas de locomoção; v. Serviços de terceiros – pessoa física e pessoa jurídica; vi. Despesas de suporte operacional; vii. Outras despesas correntes. 5 Apresentação do candidato para credenciamento A Instituição candidata deverá encaminhar os seguintes documentos para o e-mail chamadas.itps@itps.org.br , com informações submetidas em duas etapas: i. Etapa 1 – Manifestação de interesse para pré-candidatura. Envio obrigatório até às 23:59 horas, horário de Brasília/DF, do dia 29 de outubro de 2021 da Carta Consulta: documento emitido pelo responsável pela coorte, conforme modelo disponibilizado pelo ITpS ( link aqui ), apresentando os seguintes conteúdos: a. manifestação formal de interesse no credenciamento; b. argumentação sintética, limitada obrigatoriamente a duas (2) páginas, trazendo a descrição da coorte de vacinados ou sobreviventes da Covid-19 em andamento; c. perfil resumido do grupo candidato em relação aos temas da presente Chamada, apresentado como anexo à Carta Consulta, limitado obrigatoriamente a duas (02) páginas, contendo: a experiência da equipe e o perfil dos principais pesquisadores; aspectos relevantes do sistema de gestão para atendimento dos requisitos da chamada. ii. Etapa 2 – Proposta completa. Para os candidatos pré-selecionados, será enviado convite para apresentação de proposta completa. O processo seletivo completo, contendo todas as instruções de envio da proposta e critérios de avaliação será comunicado aos candidatos pré-selecionados.